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Drug
Ops
CreaDrug · module-4 · pocket-definition
session
93e44ebf6158878c
target
COX2
·
pdb
5IKT
ENGINE A
HETATM 掃描過濾
Stage 21 → 候選配體列表
21
HETATM 掃描(五層過濾)
—
AUTO
▶ Run
Engine A
↻ 重新執行 A
全自動,無需介入
stage_21_hetatm.json
ENGINE B
配體身份確認
Stage 22 → 選定配體(人機)
22
配體身份確認
—
選擇用於口袋定義的配體
✓ 確認選擇
請先選擇一個配體
▶ Run
Engine B
等待 Engine A 完成
終端執行 Engine B(人機互動,請在 DrugOps 目錄開啟終端)
複製指令
stage_22_ligand.json
ENGINE C
口袋中心計算
Stage 23 → pocket_config.json
23
重心計算 + Box size
—
▶ Run
Engine C
等待 Engine B 完成
終端執行 Engine C(口袋確認互動)
複製指令
MODULE 4 COMPLETE ✓
選定配體
—
重心座標
—
Box size
—
Padding
—
pocket_config.json
ready_for_docking = true
繼續 Module 5 →
STAGE 23 — 口袋座標確認
TLF chain A res 601 · 18 heavy atoms
center_x
—
center_y
—
center_z
—
box_size_x
—
box_size_y
—
box_size_z
—
padding
10.0 Å
修改座標
✓ 接受
座標由共結晶配體重心計算。若數值異常,請按「修改座標」手動調整。